Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-FP30511 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms