Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SHC1P29353 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHC1P29353 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHC1P29353 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms