Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD34P28906 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms