Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA3P26006 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms