Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO2P25791 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO2P25791 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO2P25791 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO2P25791 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO2P25791 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMO2P25791 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMO2P25791 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMO2P25791 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO2P25791 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO2P25791 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms