Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTGS1P23219 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTGS1P23219 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms