Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms