Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCNA2P20248 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms