Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB6P18564 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms