Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB4P16144 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB4P16144 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms