Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MUC1P15941 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MUC1P15941 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MUC1P15941 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MUC1P15941 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms