Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTHFD1P11586 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTHFD1P11586 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms