Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMC1P11047 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms