Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GLI4P10075 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms