Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NGFRP08138 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NGFRP08138 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NGFRP08138 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NGFRP08138 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms