Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ITGB3P05106 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms