Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDX58O95786 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms