Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
JRKO75564 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
JRKO75564 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JRKO75564 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JRKO75564 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JRKO75564 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JRKO75564 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
JRKO75564 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms