Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NDUFS5O43920 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms