Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COCHO43405 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
COCHO43405 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COCHO43405 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COCHO43405 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COCHO43405 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COCHO43405 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COCHO43405 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COCHO43405 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COCHO43405 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COCHO43405 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COCHO43405 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COCHO43405 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms