Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMAPO00193 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMAPO00193 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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