Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3CA6NKF2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms