Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms