Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LINC01558Q9Y6Z2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms