Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMTA1Q9Y6Y1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMTA1Q9Y6Y1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMTA1Q9Y6Y1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMTA1Q9Y6Y1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMTA1Q9Y6Y1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms