Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GJA3Q9Y6H8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms