Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C3Q9Y5Q9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms