Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP8A1Q9Y2Q0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms