Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDC42EP3Q9UKI2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDC42EP3Q9UKI2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDC42EP3Q9UKI2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDC42EP3Q9UKI2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDC42EP3Q9UKI2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDC42EP3Q9UKI2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDC42EP3Q9UKI2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDC42EP3Q9UKI2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDC42EP3Q9UKI2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CDC42EP3Q9UKI2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms