Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms