Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TFIP11Q9UBB9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms