Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC17A6Q9P2U8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms