Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HMG20BQ9P0W2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms