Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSD3Q9NYI0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSD3Q9NYI0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms