Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RLIMQ9NVW2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RLIMQ9NVW2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RLIMQ9NVW2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RLIMQ9NVW2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RLIMQ9NVW2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RLIMQ9NVW2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms