Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPMQ9NSP4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms