Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNTG1Q9NSN8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms