Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGAP35Q9NRY4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGAP35Q9NRY4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms