Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB6BQ9NRW1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms