Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms