Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HMG20AQ9NP66 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMG20AQ9NP66 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms