Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC52A2Q9HAB3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A2Q9HAB3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A2Q9HAB3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A2Q9HAB3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A2Q9HAB3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A2Q9HAB3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC52A2Q9HAB3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms