Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC90BQ9GZT6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms