Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM4Q9C037 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms