Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUS3Q9BZE2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUS3Q9BZE2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms