Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM55Q9BYV6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms