Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms