Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFT27Q9BW83 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms