Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTDSS2Q9BVG9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms