Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms